Sree Chitra Tirunal Institute develops magnetic nanoparticle-based RNA extraction kit for PCR and LAMP tests for COVID-19


Sree Chitra Tirunal Institute develops magnetic nanoparticle-based RNA extraction kit for PCR and LAMP tests for COVID-19


 
 
Chitra Magna, an innovative RNA extraction kit, has been developed by Sree Chitra Tirunal Institute for Medical Sciences and Technology (SCTIMST), an Institution of National Importance under the Department of Science and Technology, Govt. of India, as an innovative technology for isolating RNA from swabs for COVID 19 tests.
 
SARS-COV-2, the causative virus of COVID-19 pandemic, is an RNA virus– a long single-stranded polymeric substance present in all living cells that carries the genetic information of the organism necessary for life. One of the critical steps in detecting this virus is by confirming the presence of the RNA of the virus in the sample taken from the throat or nose. The sample collected is transported under specified conditions in a viral transport medium to the testing laboratory.
 
The protocol for the kit uses magnetic nanoparticles to capture and concentrate the RNA from the patient sample. This is of significant advantage because even if some viral RNA disintegrates during storage and transportation of the patient samples, all of it is captured by the magnetic bead-based extraction technology. The magnetic nanoparticle beads bind to the viral RNA and, when exposed to a magnetic field, give a highly purified and concentrated level of RNA. As the yield of PCR or LAMP test is dependent on getting an adequate quantity of viral RNA, this innovation enhances the chances of identifying positive cases. The Institute has filed for a patent for this technology, which is simpler than in imported kits.
 
Chitra Magna can be used to extract high purity RNA from patient samples not only for LAMP testing but also for the RT-PCR test. The first step of isolating high quality and high concentration of RNA without degradation is critical to the outcome of the PCR or LAMP test in which RNA is converted to DNA. Barring a few Indian manufacturers, the majority of RNA isolation kits are imported, and its non-availability often becomes a severe bottleneck for RT-PCR testing in large numbers across the country.
 
The technology of Chitra Magna has been transferred to the Agappe Diagnostics Ltd Ernakulam. The company has already taken the Chitra GeneLAMP-N technology, which uses RT-LAMP for identification of the N gene of SARS-COV-2. It is a potential confirmatory test with accuracy matching RT-PCR in its initial validation at NIV by ICMR. The test kits are now being validated in larger test samples for ICMR approval, followed by a commercial manufacturing license from DCGI. Dr. Anoop Thekkuveettil and his team, who developed Chitra GeneLAMP–N has developed the technology of Chitra Magna. All technology transfers of Sree Chitra are nonexclusive. Sree Chitra is an Institute of national importance under the department of Science and Technology, Govt of India.
 
Source  pib-
 
 

श्री चित्रा तिरुनल इंस्टीट्यूट CORID-19 के लिए PCR और LAMP परीक्षणों के लिए चुंबकीय नैनोकण आधारित RNA निष्कर्षण किट विकसित किया गया है


चित्रा मैग्ना, एक अभिनव आरएनए निष्कर्षण किट, श्री चित्रा तिरुनल इंस्टीट्यूट फॉर मेडिकल साइंसेज एंड टेक्नोलॉजी (SCTIMST), सरकार और विज्ञान और प्रौद्योगिकी विभाग के तहत राष्ट्रीय महत्व के संस्थान द्वारा विकसित किया गया है। भारत, COVID 19 परीक्षणों के लिए आरएनए को स्वैब से अलग करने के लिए एक नवीन तकनीक के रूप में।
 
SARS-COV-2, COVID-19 महामारी का प्रेरक वायरस, एक आरएनए वायरस है- सभी जीवित कोशिकाओं में मौजूद एक लंबा एकल-फंसे बहुलक पदार्थ है जो जीवन के लिए आवश्यक जीव की आनुवंशिक जानकारी को वहन करता है। इस वायरस का पता लगाने में महत्वपूर्ण चरणों में से एक गले या नाक से लिए गए नमूने में वायरस के आरएनए की उपस्थिति की पुष्टि करना है। एकत्र किए गए नमूने को वायरल परिवहन माध्यम से परीक्षण प्रयोगशाला में निर्दिष्ट शर्तों के तहत ले जाया जाता है।
 
किट के लिए प्रोटोकॉल रोगी नमूने से आरएनए को पकड़ने और ध्यान केंद्रित करने के लिए चुंबकीय नैनोकणों का उपयोग करता है। यह महत्वपूर्ण लाभ है क्योंकि यहां तक ​​कि अगर कुछ वायरल आरएनए रोगी के नमूनों के भंडारण और परिवहन के दौरान विघटित हो जाते हैं, तो यह सब चुंबकीय मनका आधारित निष्कर्षण तकनीक द्वारा कब्जा कर लिया जाता है। चुंबकीय नैनोकणों के मोती वायरल आरएनए में बंधते हैं और जब चुंबकीय क्षेत्र के संपर्क में आते हैं, तो आरएनए का अत्यधिक शुद्ध और केंद्रित स्तर देते हैं। चूंकि पीसीआर या एलएएमपी परीक्षण की उपज पर्याप्त मात्रा में वायरल आरएनए प्राप्त करने पर निर्भर है, यह नवाचार सकारात्मक मामलों की पहचान करने की संभावना को बढ़ाता है। संस्थान ने इस तकनीक के लिए एक पेटेंट के लिए आवेदन किया है, जो आयातित किट की तुलना में सरल है।
 
चित्रा मैग्ना का उपयोग न केवल LAMP परीक्षण के लिए बल्कि RT-PCR परीक्षण के लिए रोगी के नमूनों से उच्च शुद्धता RNA निकालने के लिए भी किया जा सकता है। गिरावट के बिना आरएनए की उच्च गुणवत्ता और उच्च एकाग्रता को अलग करने का पहला चरण पीसीआर या एलएएमपी परीक्षण के परिणाम के लिए महत्वपूर्ण है जिसमें आरएनए को डीएनए में परिवर्तित किया जाता है। कुछ भारतीय निर्माताओं को छोड़कर, अधिकांश आरएनए आइसोलेशन किट आयात किए जाते हैं, और इसकी गैर-उपलब्धता अक्सर देश भर में बड़ी संख्या में आरटी-पीसीआर परीक्षण के लिए एक गंभीर अड़चन बन जाती है।
 
चित्रा मैग्ना की तकनीक को एगप्पे डायग्नोस्टिक्स लिमिटेड एर्नाकुलम में स्थानांतरित कर दिया गया है। कंपनी ने पहले ही चित्रा जीनप्ले-एन तकनीक ले ली है, जो एसएआरएस-सीओवी -2 के एन जीन की पहचान के लिए आरटी-एलएएमपी का उपयोग करती है। आईसीएमआर द्वारा एनआईवी में इसकी प्रारंभिक मान्यता में आरटी-पीसीआर से मेल खाते हुए सटीकता के साथ यह संभावित पुष्टिकरण परीक्षण है। ICMR अनुमोदन के लिए परीक्षण किट अब बड़े परीक्षण नमूनों में मान्य किए जा रहे हैं, इसके बाद DCGI से वाणिज्यिक विनिर्माण लाइसेंस प्राप्त किया गया है। डॉ। अनूप थेक्वेवेटिल और उनकी टीम, जिन्होंने चित्रा जेनेम्प-एन को विकसित किया, ने चित्रा मैग्ना की तकनीक विकसित की है। श्री चित्र के सभी प्रौद्योगिकी हस्तांतरण कोई भी प्रशंसनीय नहीं हैं। श्री चित्रा, भारत सरकार के विज्ञान और प्रौद्योगिकी विभाग के तहत राष्ट्रीय महत्व का संस्थान है।
 
स्रोत pib-
 
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